| 作 者 |
王菁, 李桂英, 陈志炜, 郭焕娣, 龚晓晴, 王忠良 |
| 第一作者 |
王菁 |
| 作者单位 |
广东海洋大学水产学院,广东湛江 |
| 卷 号 |
50 |
| 发表年份 |
2022 |
| 发表刊期 |
6 |
| 发表页面 |
86-90 |
| 关 键 字 |
马氏珠母贝；全长转录组；SSR标记；可变剪切 |
| 摘 要 |
［目的］开发马氏珠母贝（Pinctada fucata）基因组资源，挖掘功能基因。［方法］以马氏珠母贝血细胞为试材，利用单分子实时技术（singlemolecule real time,SMRT）进行全长转录组测序，并对所获得unigenes进行功能注释和基因结构分析。［结果］共获得277 064条全长非嵌合序列和82 381个基因。经过比对nr、SwissProt、KEGG 和 KOG数据库进行注释和功能分类后，共得到59 621个注释基因。同时，在8 493条基因中共发现11 219个SSR位点，其中以二核苷酸重复基元类型最高（50.9%）。生物信息学分析鉴定得到20 013个lncRNA、2 004个转录因子、10 522个可变剪切分析位点。［结论］使用SMRT技术能够深入挖掘马氏珠母贝全长转录组数据，为进一步探讨马氏珠母贝功能基因的挖掘、免疫响应及遗传机制的研究提供可靠的基因组资源。 |
| 附 件 |
马氏珠母贝（Pinctada fucata）血细胞全长转录组测序与分析 |
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